Eddike kan holde i lang tid, næsten uendelige, og kan opbevares i enten en glas- eller plastflaske. Metal flasker kan ikke anbefales, da surhedsgraden i eddike kan reagere med metallet. Brug enten en plastik skruelåg eller kork-top til at forsegle en flaske; en skrue top er bedre for langtidsopbevaring. Hvis du bruger en metal skrue-top, vælge en fremstillet af ikke-corrodable metal.The flaskehalsen er ofte smalle, at forhindre dig i at hælde for meget på én gang.
Specielle Eddike Bottle Typer

Den sjældneste balsamico eddike, aceto balsamico tradizionale, sælges kun i løg-formede flasker. Andre balsamico eddike, såsom condimento og mindre kvalitet balsamico eddike, kan sælges i en hvilken som helst flaske. Andre speciale eddike flasker omfatter dem, der anvendes til flavored eddike, ofte med de aromaer, såsom frisk urt stængler eller hele chili peber, gemt inde i flasken med eddike som dekoration og til at skabe stærkere smag over tid. Vælg små, dekorative flasker fordi flavored eddike har en holdbarhed på 2 til 3 måneder, hvis opbevaret ved stuetemperatur og 6 til 8 måneder, hvis opbevaret i køleskabet. Hvis du vil lave dine egne flavored eddiker, vælge genlukkelige beholdere af glas uden ridser eller revner.