Frøene findes i midten af ​​en jalapeno peber og er omgivet af en membran . Denne membran er, hvor de fleste af capsaicin i jalapeno, så det er den varmeste del af peber. Frø og membran kan anvendes i madlavning, men ofte fjernet. Dette gøres ved at skære jalapeno i halve og skære ned på længden af ​​peber under marven, med en skarp kniv.
Flesh

Kødet er den grønne del, der udgør det meste af jalapeno. En moden jalapeno har en blank og fast kød på ydersiden og bør ikke have blå mærker eller bløde pletter. Den indeholder capsaicin i lavere koncentrationer end i frø og membran, så er ikke så varmt som disse dele. Det er den vigtigste del af jalapeno bruges i madlavning og stadig tilføjer masser af varme til et fad.
Pith

marv er den hvide del af jalapeno peber og findes inde i kødet. Frøene og deres membran er fastgjort til marven, men marven selv indeholder lidt varme. Det kan være vundet ud til madlavning ved forsigtigt under det udskæring med en skarp kniv. Det fjernede også frø og membran, men disse kan holdes til side og tilføjet til en skål for sig, hvis det kræves.
Stem

Stammen af ​​et jalapeno er den hårde del, der lægger jalapeno til resten af ​​planten som det vokser. Det er grønt, ligesom resten af ​​peber, men har en anden tekstur til kødet. Jalapeno stængler er normalt ikke bruges i madlavning. De kan fjernes ved skæring vandret over toppen af ​​peber med en kniv.