Any peper kan worden gebruikt om de warmte van de chipotle vervangen, zoals verse jalapenos, Serranos of poblanos. Gedroogde cayennepeper of hete saus zou ook werken. De hoeveelheid warmte bijgebracht door de paprika's kunnen worden aangepast aan de individuele smaak: Voor een mildere smaak, verwijder de binnenste membraan en zaden en hak de buitenkant van de peper, en voor een sterkere warmte laat de zaadjes en het membraan intact
. Elk type van hete peper kan worden gebruikt om chipotle paprika vervangen.
gerookte Peppers

Chipotles worden gerookt, en hoewel ze te vervangen door een andere hete peper zal de juiste warmte te geven aan een gerecht , de duidelijke rokerige smaak zal missen. Een goede vervanger is een ander type van gerookte hete peper, zoals pasilla de Oaxaca. Een verscheidenheid van gerookte paprika's zijn beschikbaar ingeblikt, jarred of gedroogd in veel supermarkten.
Chipotles in Adobo

Chipotles worden vaak verkocht ingeblikt in adobo, dat is een kruid en op basis van tomaten saus. Een goede vervanging voor dergelijke chipotle is elk van de bovengenoemde paprika gemengd met een steak saus. Dit zal de smaak en consistentie van chipotles in adobo vrij goed te repliceren in een snuifje.